More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3121 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
284 aa  551  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.79 
 
 
301 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
306 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
306 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
315 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  48.94 
 
 
301 aa  178  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.65 
 
 
309 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
348 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
348 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
348 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
292 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 
293 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 
295 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
289 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
289 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
292 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
275 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
269 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
238 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
260 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0334  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.5 
 
 
268 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
253 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.361501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  39.68 
 
 
260 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
264 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.17 
 
 
259 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
284 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 
259 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.05 
 
 
241 aa  99.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 
238 aa  99  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  36.54 
 
 
1270 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
264 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
239 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.57 
 
 
242 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  40.57 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
251 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
247 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
266 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
239 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
249 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
284 aa  92.8  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
256 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5536  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
248 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
248 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
260 aa  92  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0717939  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.14 
 
 
258 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
233 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  30.49 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  37.79 
 
 
258 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3168  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.273274  normal  0.685188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
248 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
238 aa  90.5  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  39.15 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
245 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.54 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  36.13 
 
 
259 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>