More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12160 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  68.15 
 
 		 291 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  68.15 
 
 		 294 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  68.15 
 
 		 294 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  67.24 
 
 		 295 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  66.78 
 
 		 292 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  47.99 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  42.14 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.39 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.97 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 		 242 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 		 268 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.26 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 254 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.03 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.89 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.36 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  38.22 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  30.34 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.26 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.45 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.03 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 262 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>