More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0897 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0717939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  37.14 
 
 		 847 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  36 
 
 		 847 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 338 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  34.46 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  32.84 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 261 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1893  3-hydroxy acid dehydrogenase  30.96 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 317 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 280 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 284 aa  98.6  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 294 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 281 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3404  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  33.47 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.39 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 239 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>