More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3477 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  100 
 
 
292 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  85.57 
 
 
295 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  68.04 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  66.78 
 
 
293 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  68.04 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  68.04 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 
305 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
306 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  42.26 
 
 
301 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
292 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
315 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 
348 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 
348 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 
348 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
306 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
309 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
289 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
275 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 
278 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
254 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
285 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
268 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
270 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 
285 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
267 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.76 
 
 
284 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.76 
 
 
284 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.76 
 
 
284 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
247 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
267 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
261 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.54 
 
 
254 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.212128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
245 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
248 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
263 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
248 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
263 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
263 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
263 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
263 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
263 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  32.35 
 
 
234 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
279 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12763  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
272 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.382037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
248 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.02 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
279 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
271 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
279 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.346421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
274 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0669202  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
254 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.42 
 
 
250 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
269 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
270 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
279 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.28 
 
 
230 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.9 
 
 
238 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
253 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
260 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
254 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
261 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
269 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
238 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
269 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
269 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
269 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
278 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281584  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
254 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
242 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
265 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110781  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
271 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.46 
 
 
264 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
249 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.46 
 
 
264 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.46 
 
 
264 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
269 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
248 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
247 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.48 
 
 
275 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.07 
 
 
247 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
233 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.28 
 
 
252 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
269 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>