More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5417 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  593  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  55.03 
 
 
305 aa  289  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  52.68 
 
 
301 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
315 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.77 
 
 
306 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.45 
 
 
309 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
291 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  48.73 
 
 
294 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  46.57 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 
348 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 
348 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 
348 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
284 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  43.96 
 
 
292 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 
295 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
301 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 
289 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
289 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
275 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
275 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.21 
 
 
238 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.38 
 
 
238 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
242 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
242 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
242 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
242 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
242 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
285 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
268 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742124  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
242 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.15 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.9 
 
 
241 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.15 
 
 
239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  35.86 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
242 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.51 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
270 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
274 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  34 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137125  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
294 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  38.86 
 
 
242 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
268 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.14 
 
 
247 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
268 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
254 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
242 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  37.71 
 
 
242 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
267 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  38.29 
 
 
241 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01089  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2554  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.3114e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1214  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1472  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000346671  hitchhiker  0.00000000000000508287 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2034  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  decreased coverage  0.000000561813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000339194  hitchhiker  0.00000190522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
254 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01097  hypothetical protein  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000400605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1215  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
269 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2231  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
244 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000399569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
270 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
250 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37.43 
 
 
245 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
269 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  37.99 
 
 
247 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.03 
 
 
230 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
339 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
258 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
254 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1528  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  36.56 
 
 
245 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.150562  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
242 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.98 
 
 
248 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
277 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
244 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  33.78 
 
 
254 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
278 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1588  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.95 
 
 
247 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0299797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
247 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1645  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.95 
 
 
247 aa  106  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.633684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 
276 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>