More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1853 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  90.36 
 
 		 249 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  78.31 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  78.31 
 
 		 249 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  78.31 
 
 		 249 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  77.11 
 
 		 253 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  55.47 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  55.23 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  52.5 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  48.96 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 		 289 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 		 291 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01994  short chain dehydrogenase  50.81 
 
 		 130 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000979327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  37.19 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  31.93 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  33.85 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  34.69 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12531  short-chain type dehydrogenase/reductase  31.76 
 
 		 268 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 299 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0134  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 282 aa  92  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 344 aa  92  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 338 aa  92  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.29 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1119  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.17 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>