More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2850 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
485 aa  944    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182796  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2232  hypothetical protein  49.59 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.78 
 
 
508 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3236  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.53 
 
 
510 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.593017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1902  hypothetical protein  48.78 
 
 
499 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.382809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4579  hypothetical protein  49.39 
 
 
499 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17787  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  46.22 
 
 
501 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  46.22 
 
 
501 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2899  hypothetical protein  46.34 
 
 
499 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.109338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  50.4 
 
 
501 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6586  carbohydrate kinase, YjeF related protein  51.22 
 
 
501 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.3812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1965  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.91 
 
 
539 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2388  hypothetical protein  46.54 
 
 
499 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3587  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.27 
 
 
496 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2560  hypothetical protein  47.15 
 
 
519 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.45 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5131  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.6 
 
 
500 aa  324  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1546  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.09 
 
 
496 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2191  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.51 
 
 
522 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.636409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2650  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.29 
 
 
507 aa  316  6e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3313  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.76 
 
 
499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  44.72 
 
 
493 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2373  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.08 
 
 
507 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4460  carbohydrate kinase, YjeF related protein  48.12 
 
 
509 aa  309  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2329  carbohydrate kinase, YjeF related protein  49.8 
 
 
507 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896222  normal  0.257652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1387  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.36 
 
 
490 aa  300  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470651  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2229  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.99 
 
 
538 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.355484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0751  YjeF family protein  36.75 
 
 
463 aa  295  2e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.553827  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0322  sugar kinase  37.15 
 
 
466 aa  289  9e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1517  YjeF-related protein-like  40.86 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.126424 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1332  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.86 
 
 
476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.977936  normal  0.520853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1922  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.85 
 
 
490 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.62 
 
 
490 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1837  yjeF related protein  43.65 
 
 
523 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1024  YjeF-related protein-like  41.46 
 
 
528 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0048  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.57 
 
 
468 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1547  hypothetical protein  48.96 
 
 
526 aa  253  6e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.831986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3322  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.56 
 
 
492 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0650972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4659  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.99 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.54 
 
 
529 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1191  YjeF-related protein-like protein  40.14 
 
 
449 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.68 
 
 
514 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.58 
 
 
520 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.45 
 
 
499 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.97 
 
 
519 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.68 
 
 
513 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.08 
 
 
514 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.12 
 
 
499 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 
533 aa  203  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.2 
 
 
511 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.08 
 
 
521 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.14 
 
 
524 aa  200  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  37.65 
 
 
502 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
524 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.61 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2286  hypothetical protein  36.21 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.2474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
515 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 
509 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0355  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.31 
 
 
500 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.97 
 
 
528 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.26 
 
 
511 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.4 
 
 
490 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  31.92 
 
 
517 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
504 aa  193  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.78 
 
 
521 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  37.78 
 
 
502 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  40.72 
 
 
507 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.4 
 
 
531 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.02 
 
 
527 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  33.95 
 
 
496 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.06 
 
 
525 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
531 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.6 
 
 
513 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.58 
 
 
510 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1786  YjeF-related protein-like  36.02 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.77 
 
 
512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  32.67 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  32.67 
 
 
504 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.46 
 
 
524 aa  183  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.31 
 
 
519 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  35.85 
 
 
530 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2346  carbohydrate kinase family protein  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2307  nitric-oxide reductase subunit C  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1448  carbohydrate kinase, putative  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2465  sugar kinase  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  33.87 
 
 
498 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1941  putative carbohydrate kinase  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3364  putative carbohydrate kinase  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.36405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  32.46 
 
 
504 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1214  putative carbohydrate kinase  35.79 
 
 
531 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.4 
 
 
512 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.44 
 
 
492 aa  182  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  31.2 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  35.68 
 
 
503 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  37.73 
 
 
436 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  33.13 
 
 
496 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  33.93 
 
 
499 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.54 
 
 
501 aa  179  9e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.92 
 
 
530 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
515 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>