More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2376 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  854    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  66.9 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  59.25 
 
 		 427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  59.02 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  55.79 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  56.03 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  56.84 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  58.69 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  56.16 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  52.11 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  52.46 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  49.42 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  45.63 
 
 		 428 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  42.86 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 428 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  42.41 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  43.86 
 
 		 432 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 427 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 435 aa  249  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  37.19 
 
 		 430 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 433 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  37.99 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  40.48 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 425 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 433 aa  170  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.4 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  30.77 
 
 		 427 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  29.21 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  30.53 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 428 aa  153  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  29.21 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  27.55 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  32.28 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  27.55 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  30.62 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>