More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0888 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  54.9 
 
 		 322 aa  296  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 		 297 aa  149  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  33.57 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.76 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.45 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  32.82 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  25.56 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  29.29 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7224  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2130  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.48 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0181  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  24.29 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.14 
 
 		 262 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  32.23 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.46 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 390 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  20.85 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  20.85 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  26.36 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>