More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7224 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7224  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
341 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3497  alpha/beta hydrolase fold protein  54.79 
 
 
335 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  29.09 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  27.34 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  33.04 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  38.58 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  22.91 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25619  predicted protein  26.16 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.87 
 
 
311 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
291 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
291 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
291 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.7 
 
 
277 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  35.43 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
263 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
257 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  28.74 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
288 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
297 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  23.92 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 
272 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1812  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  27.27 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 
290 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  23.92 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
253 aa  61.2  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
294 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  27.87 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
287 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.37 
 
 
263 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.48 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3010  magnesium chelatase accessory protein  26.41 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219603  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 
255 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
270 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
243 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
303 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 
324 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  33.64 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  33.64 
 
 
304 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  33.64 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  31.78 
 
 
286 aa  59.7  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
291 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  31.62 
 
 
296 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
294 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
294 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 
324 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.74 
 
 
341 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
291 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
259 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0487  Alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  37.21 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>