More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_2022 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  100 
 
 		 206 aa  427  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  45 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  44.38 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  38.54 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  42.36 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  42.42 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  37.63 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  42.86 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  43.42 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  48.11 
 
 		 369 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 249 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40.6 
 
 		 248 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  44.19 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  41.67 
 
 		 150 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  41.35 
 
 		 226 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  40.27 
 
 		 404 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 382 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  42.28 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  45.45 
 
 		 407 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 418 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  37.14 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 407 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 404 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 177 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 407 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 364 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.49 
 
 		 224 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  45.22 
 
 		 212 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  46.23 
 
 		 363 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 407 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 354 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 363 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 407 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  47.17 
 
 		 407 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  45.45 
 
 		 404 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  38.69 
 
 		 177 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  45.83 
 
 		 287 aa  91.7  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  46.23 
 
 		 363 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  45.83 
 
 		 279 aa  91.7  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 353 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  37.96 
 
 		 177 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  47.75 
 
 		 224 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 150 aa  91.3  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  46.09 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  46.49 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.49 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  40 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.61 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  43.97 
 
 		 177 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  34.78 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.35 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  41.46 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  41.46 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  43.48 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.22 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  36.14 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.51 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  41.73 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.51 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.51 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.51 
 
 		 218 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.51 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.51 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.51 
 
 		 234 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  45.05 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  44.14 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  39.39 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  35.33 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  41.22 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  37.11 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  37.88 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  38.51 
 
 		 319 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  44.95 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  44.14 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  37.12 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  40.17 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.68 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  39.69 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000856339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  38.21 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>