More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6799 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6799  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6954  transcriptional regulator, LysR family  66.91 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2476  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3625  transcriptional regulator, LysR family  52.44 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1659  transcriptional regulator, LysR family  52.29 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  35.57 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7048  transcriptional regulator, LysR family  33.02 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3644  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0374  transcriptional regulator, LysR family  30.59 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  34.67 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0613  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723423  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0687  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.16 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  34.55 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2328  transcriptional regulator  38.29 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.475016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5933  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1324  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4891  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0719515  hitchhiker  0.000498702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  31.19 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3838  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3673  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4510  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0990814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3854  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  32.74 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.12 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4560  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4333  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  30.71 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3076  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.513194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  32.72 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3222  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.759857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0252  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.682198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2215  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2242  LysR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478296  normal  0.0538104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1847  transcriptional regulator, LysR family  27.92 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3751  LysR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657019  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4473  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4472  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6711  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3159  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358465  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  31.22 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0443  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  39.68 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3783  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>