More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1324 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1324  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 288 aa  563  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1877  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018924  normal  0.0294674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.64 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5862  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  38.42 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3510  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  38.39 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1282  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2818  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246785  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2307  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.870686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2919  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.495437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  39.2 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.9 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0442  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  34.36 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  34.36 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  32.72 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.05 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  32.72 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  32.72 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  32.72 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4374  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1421  transcriptional regulator, LysR family  39.11 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1278  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  33.83 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  33.83 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  33.83 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2703  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.907055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0691  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.780494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 303 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1516  transcriptional regulator, LysR family  36.87 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  29.29 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 314 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.33 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  64.18 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4827  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>