More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3783 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3783  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2723  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.61 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.63808  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1649  fhu operon transcription regulator  26.55 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.133546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2937  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4436  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53692  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  24.6 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  27.17 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0408  transcriptional regulator, MarR family  28.64 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.00908682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2202  transcriptional regulator, LysR family  30.96 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6254  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2863  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.97885  normal  0.374459 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  24.6 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2117  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.052237  normal  0.387945 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0368  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  27.69 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.63 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  24.91 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4819  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2773  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  24.3 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  24.19 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2919  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.66 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0525  fhu operon transcriptional regulator  27.93 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.262224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  26.97 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  23.08 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0848  LysR-family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00362304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.66 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.66 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.66 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.66 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.66 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1656  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.09 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2625  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0375  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  26.89 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5289  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127771  normal  0.048203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  24.22 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1728  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0157868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  23.29 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  24.23 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0812  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0254349  normal  0.598657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0751  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000639538  normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  26.54 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  26.54 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0739  LysR-family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000050568  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  26.54 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  26.54 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0644  regulatory protein, LysR  27.5 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>