More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2202 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2202  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 293 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1778  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  25.62 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0572  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0935642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  21.99 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  21.77 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  25.31 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  23.83 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  22.11 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  23.85 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  23.85 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  23.85 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  22.79 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  23.85 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  23.85 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0858  transcriptional regulator, LysR family  26.84 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521501  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  23.47 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3737  transcriptional regulator, LysR family  25.7 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.295793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.16 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2030  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0152  transcriptional regulator, LysR family  25.83 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  24.5 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  24.5 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  24.5 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  23.34 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  22.95 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0943  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 293 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  23.24 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  22.26 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  25.59 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  20.82 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  25.31 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  24.1 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  24.1 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  25.19 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2760  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00129755  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0291  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  23.23 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.11 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  23.46 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.53 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.17 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  27.32 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>