More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1778 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1778  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  620  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2202  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.28 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0691  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.780494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  26.78 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  27.12 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  27.98 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.84 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  29.61 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  27.9 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  23.49 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  30.28 
 
 		 294 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.82 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.82 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.82 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 343 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  23.49 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  23.13 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  23.49 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  35.9 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3076  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.36 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 337 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3085  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.28 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.49 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.28 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.28 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  26.96 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.28 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  22.78 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.28 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  22.78 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0954  transcriptional regulator, LysR family  28.45 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0054169  hitchhiker  0.000000358715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  28.64 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  28.38 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 309 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>