More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4573 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 340 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0374  transcriptional regulator, LysR family  58.54 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7048  transcriptional regulator, LysR family  43.93 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6954  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3644  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1659  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6799  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2476  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3625  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5933  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593223  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.22 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5055  transcriptional regulator, LysR family  42.22 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  38.22 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 297 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 297 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 297 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  37.69 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  37.69 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.6 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  39.3 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6215  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26300  transcriptional regulator  37.06 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.27 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2558  DNA-binding transcriptional activator XapR  31.94 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000632847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  34.55 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  34.55 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  34.55 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  30.27 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1258  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000639687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  32.82 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  35.79 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  32.82 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  32.82 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  32.82 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0620  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  37.44 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5278  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.786884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5367  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5657  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  32.82 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  37.17 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4580  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.308792  normal  0.669632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4315  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>