More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6215 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6215  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 279 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5862  transcriptional regulator, LysR family  44.84 
 
 		 323 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  46.12 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  39.26 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1877  transcriptional regulator, LysR family  37.99 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018924  normal  0.0294674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5081  transcriptional regulator, LysR family  43.41 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  37.61 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.99 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1931  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 347 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.846594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  41.74 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0152  transcriptional regulator, LysR family  35.58 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  41.31 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  40.85 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2250  LysR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.199653  normal  0.0159949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3963  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  38.52 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  43.13 
 
 		 337 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  42.49 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  36.87 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  36.57 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.02 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  38.25 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  34.3 
 
 		 293 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.49 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1190  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3941  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140438  decreased coverage  0.00710998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  39.07 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  32.71 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  39.07 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  39.07 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  39.07 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  39.07 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  33.97 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.97 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  33.97 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  33.97 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  33.97 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 300 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  38.5 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 316 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  38.5 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 317 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4520  Transcriptional regulator-like protein  35.94 
 
 		 291 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.15 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>