More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7048 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7048  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 328 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4573  Transcriptional regulator-like protein  43.93 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0374  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6954  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6799  transcriptional regulator, LysR family  33.02 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.927236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5933  transcriptional regulator, LysR family  33.96 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5055  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3644  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 327 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1659  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.77 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3625  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2476  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  32.58 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  35.94 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  37.37 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3963  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.81 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.81 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1931  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.846594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  33.51 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  26.6 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  26.6 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  26.6 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  26.6 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  26.6 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4315  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2332  LysR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.285545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  27.27 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0337  transcriptional regulator, LysR family  42.02 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0334498  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  38.17 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  38.17 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  28.52 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>