More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6539 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  799    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  37.91 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  35.43 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  30.2 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  29.62 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  29.44 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  32.71 
 
 		 411 aa  116  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 406 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 415 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  29.07 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6955  hypothetical protein  29.2 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.123489  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.86 
 
 		 418 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.89 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.46 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.19 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.58 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.58 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.58 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.58 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.58 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  27.3 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 474 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.87 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.65 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.65 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.65 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.25 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.12 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.81 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.2 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.5 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.65 
 
 		 1829 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>