45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5274 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 897 aa  1810    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10277  Alpha-rhamnosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU8]  41.21 
 
 		 661 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  31.85 
 
 		 1107 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  33.92 
 
 		 883 aa  194  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1216  alpha-L-rhamnosidase  32.18 
 
 		 856 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3740  alpha-L-rhamnosidase  34.24 
 
 		 831 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00224496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  24.95 
 
 		 728 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  35.61 
 
 		 524 aa  124  8e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  26.2 
 
 		 734 aa  115  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  25.7 
 
 		 572 aa  114  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0959  alpha-L-rhamnosidase  27.19 
 
 		 585 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.8736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  24.67 
 
 		 734 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  28.95 
 
 		 765 aa  104  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  25.33 
 
 		 1187 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  24.07 
 
 		 955 aa  90.1  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  40.48 
 
 		 128 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  33.74 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.5 
 
 		 801 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  23.45 
 
 		 831 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1945  alpha-L-rhamnosidase  24.87 
 
 		 819 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970344  normal  0.175983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1503  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.85 
 
 		 1577 aa  67.4  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3976  alpha-L-rhamnosidase  21.98 
 
 		 796 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6026  alpha-L-rhamnosidase  20.61 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  43.86 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  21.89 
 
 		 936 aa  62.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.62 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  23.55 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3428  hypothetical protein  39.74 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660009  hitchhiker  0.0000342661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  23.1 
 
 		 793 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  46.3 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  32.17 
 
 		 818 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  44.44 
 
 		 760 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  43.33 
 
 		 430 aa  55.1  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02631  alpha-L-rhamnosidase C, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02880)  26.74 
 
 		 568 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361171  normal  0.741957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  25.97 
 
 		 774 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  21.49 
 
 		 775 aa  52  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  18.49 
 
 		 839 aa  51.2  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  21.77 
 
 		 949 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  42.59 
 
 		 550 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  34.38 
 
 		 544 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  21.19 
 
 		 826 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  22.69 
 
 		 755 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6094  Glycogen debranching protein-like protein  28.18 
 
 		 815 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.709243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.27 
 
 		 848 aa  45.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000620  hypothetical protein  34.74 
 
 		 959 aa  44.3  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>