247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2670 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2670  NLP/P60 protein  100 
 
 		 818 aa  1657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  35.62 
 
 		 447 aa  73.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2622  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.37 
 
 		 203 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 285 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  27.89 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 326 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  32.77 
 
 		 194 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  30.5 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  32.65 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  35.09 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  32.7 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  31.96 
 
 		 368 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  31.25 
 
 		 302 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  30.38 
 
 		 546 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 192 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  35.65 
 
 		 220 aa  57.4  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  34.86 
 
 		 370 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 225 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 211 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  28.63 
 
 		 256 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 256 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  28.63 
 
 		 256 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 256 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 192 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 532 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  32.39 
 
 		 248 aa  57  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  32.97 
 
 		 473 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 278 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 248 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  34.62 
 
 		 231 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  31.35 
 
 		 256 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  29.73 
 
 		 256 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 273 aa  55.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 257 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 257 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 335 aa  55.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  31.75 
 
 		 257 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  30.05 
 
 		 475 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 475 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  30.05 
 
 		 475 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  30.93 
 
 		 367 aa  54.7  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 479 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 478 aa  54.3  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 392 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  28.26 
 
 		 487 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 164 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  31.45 
 
 		 187 aa  53.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  28.78 
 
 		 476 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  35.24 
 
 		 283 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  32.2 
 
 		 215 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  32.26 
 
 		 432 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  35.87 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 505 aa  53.5  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  35.24 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  35.24 
 
 		 283 aa  52.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  33.65 
 
 		 234 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  33.65 
 
 		 234 aa  52.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  31.96 
 
 		 366 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  36.26 
 
 		 190 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  29.57 
 
 		 209 aa  52.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  32.46 
 
 		 133 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  33.65 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  33.65 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  33.65 
 
 		 234 aa  52.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  33.65 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  33.65 
 
 		 218 aa  52.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  36.43 
 
 		 298 aa  52.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  34.44 
 
 		 335 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 234 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 209 aa  52.4  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  33.66 
 
 		 201 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  34.26 
 
 		 1048 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 345 aa  52.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  35.96 
 
 		 369 aa  52  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  34.95 
 
 		 216 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  36.54 
 
 		 245 aa  52  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  37.74 
 
 		 391 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 116 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  32.73 
 
 		 222 aa  51.6  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  37.08 
 
 		 364 aa  52  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  31.91 
 
 		 234 aa  52  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  31.5 
 
 		 469 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  35.24 
 
 		 283 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  34.29 
 
 		 199 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  32.09 
 
 		 467 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 467 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  31.5 
 
 		 469 aa  51.6  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  32.99 
 
 		 347 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 269 aa  51.6  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  31.5 
 
 		 469 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  33.03 
 
 		 215 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  31.5 
 
 		 469 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  50.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  31.71 
 
 		 467 aa  51.2  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>