42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2327 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1024    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3650  hypothetical protein  34.19 
 
 		 461 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0309  hypothetical protein  40.54 
 
 		 315 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2718  hypothetical protein  31.42 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.94605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4489  hypothetical protein  38.41 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.718463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1942  hypothetical protein  29.6 
 
 		 449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  0.229464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1379  XRE family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.464445  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0334  hypothetical protein  30.53 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  25.99 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  29.2 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  26.47 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  27.07 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  28.22 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9064  hypothetical protein  26.12 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  26.57 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  24.46 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0037  transcriptional regulator, XRE family  23.53 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1710  transcriptional regulator, XRE family  28.25 
 
 		 420 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.371639  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  31.84 
 
 		 524 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  27.07 
 
 		 487 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5409  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  26.06 
 
 		 565 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  25.1 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3992  putative regulatory protein  31.62 
 
 		 249 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  24.79 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1813  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  23.79 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  30.15 
 
 		 468 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4913  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  27.55 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0597  hypothetical protein  27.42 
 
 		 475 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1653  XRE family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0453749  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1481  transcriptional regulator, XRE family  25.41 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  normal  0.39369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  25.47 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3080  hypothetical protein  22.46 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4907  transcriptional regulator, XRE family  25.2 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  26.58 
 
 		 449 aa  43.9  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 461 aa  43.5  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  27.07 
 
 		 579 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>