More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1549 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 472 aa  942    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  61.98 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  53.51 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 		 460 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  54.69 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  55.58 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  53.44 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  48.48 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  49.56 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  49.56 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  48.55 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  48.3 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  45.47 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  48.18 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  46.09 
 
 		 466 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 482 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  45.97 
 
 		 460 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  46.05 
 
 		 475 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  46.49 
 
 		 468 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  45.23 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  43.99 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 468 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  42.92 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 		 491 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  43.65 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  44.11 
 
 		 491 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  41.79 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  41.93 
 
 		 456 aa  262  8e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  40.27 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  34.32 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  33.64 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.18 
 
 		 465 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.71 
 
 		 465 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.06 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  33.49 
 
 		 462 aa  193  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 		 472 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 463 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.36 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  31.61 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  32.25 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.09 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.95 
 
 		 462 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  34.07 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 463 aa  174  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.37 
 
 		 470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  31.79 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  33.99 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 486 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.45 
 
 		 424 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  33.01 
 
 		 424 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.01 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.66 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 424 aa  151  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.58 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>