More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0977 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  100 
 
 		 328 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  68.12 
 
 		 318 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  68.12 
 
 		 318 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  66.33 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  64.26 
 
 		 317 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  65.44 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  62.38 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  62.5 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  60.73 
 
 		 305 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.25 
 
 		 307 aa  345  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  44.04 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.45 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.13 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.83 
 
 		 313 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  34.97 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  31.83 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  31.79 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  28.8 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  34.38 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  40.28 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.64 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  41.12 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.88 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  40.38 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.89 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.57 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  30.69 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  40.81 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 259 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.84 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  35.67 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  32.42 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  39.44 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  33.44 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  40 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  33.46 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  36.36 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.18 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.65 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.19 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  39.52 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  41.31 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.33 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.53 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  36.57 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.84 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  37.39 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  29.28 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  38.43 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  38.22 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.52 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  37.16 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.91 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.2 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  34.15 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  37.04 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.34 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  33.12 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.81 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  41.5 
 
 		 391 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.25 
 
 		 247 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.51 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  33.77 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  33.98 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  28.62 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 259 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.51 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  30.52 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  40 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.36 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  35.75 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  35.65 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  30.59 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  36.67 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  34.86 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.42 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  37.21 
 
 		 741 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  36.82 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  30.92 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  34.77 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.84 
 
 		 282 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  39.35 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.26 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>