124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0891 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 438 aa  890    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2255  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  37.73 
 
 		 440 aa  256  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190437  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0625  extracellular solute-binding protein family 1  37.14 
 
 		 437 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7806  extracellular solute-binding protein family 1  35.94 
 
 		 452 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.76 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  24.16 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.08 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.58 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.6 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.47 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 422 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 410 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  26.12 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.63 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.11 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  30.82 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  24.48 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5856  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 461 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.62 
 
 		 479 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3132  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.11 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal  0.0111617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 478 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5528  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  21.61 
 
 		 485 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  26.21 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.94 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  21.48 
 
 		 455 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 414 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>