More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2012 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  100 
 
 		 611 aa  1251    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 598 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 598 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  42.48 
 
 		 598 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 603 aa  485  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 603 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 603 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  42.55 
 
 		 603 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  39.8 
 
 		 600 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 598 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  39.34 
 
 		 608 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  38.21 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 607 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  40.11 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  37.41 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 659 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 652 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  35.45 
 
 		 601 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  34.62 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 602 aa  329  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  32.35 
 
 		 597 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 602 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 683 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  30.33 
 
 		 666 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 628 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  30.25 
 
 		 668 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 668 aa  313  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  30.49 
 
 		 666 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  32.08 
 
 		 600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  29.77 
 
 		 670 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 672 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 622 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  28.48 
 
 		 669 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  33.62 
 
 		 604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  33.39 
 
 		 604 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 672 aa  303  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  29.37 
 
 		 669 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 669 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 669 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  28.83 
 
 		 677 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  28.83 
 
 		 677 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 604 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  32.21 
 
 		 616 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  32.18 
 
 		 604 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  32.66 
 
 		 637 aa  296  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.02 
 
 		 677 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  32.19 
 
 		 615 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  29.73 
 
 		 621 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 635 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 604 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  29.85 
 
 		 665 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  28.36 
 
 		 677 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  29.73 
 
 		 626 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 621 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  31.22 
 
 		 634 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 624 aa  289  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  30.41 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 677 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  31.81 
 
 		 623 aa  287  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  30.78 
 
 		 612 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  30.14 
 
 		 621 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  30.61 
 
 		 599 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  30.46 
 
 		 643 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  32.6 
 
 		 618 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  31.77 
 
 		 633 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.51 
 
 		 643 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 643 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 618 aa  279  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  30.5 
 
 		 603 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  30.43 
 
 		 667 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  30.42 
 
 		 588 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  30.17 
 
 		 586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  29.39 
 
 		 630 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 591 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  28.55 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  31.19 
 
 		 622 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 585 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  28.19 
 
 		 635 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 634 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  31.57 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  31.57 
 
 		 591 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 635 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  31.06 
 
 		 638 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 634 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  29.85 
 
 		 585 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 634 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 586 aa  251  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 635 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  28.72 
 
 		 620 aa  250  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  28.52 
 
 		 630 aa  249  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 620 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 585 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 623 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>