More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1089 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  100 
 
 		 300 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  54.79 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  53.63 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  57.09 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  53.1 
 
 		 293 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  53.1 
 
 		 293 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  53.1 
 
 		 293 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  58.76 
 
 		 294 aa  316  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  53.29 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  52.76 
 
 		 293 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  53.61 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  52.94 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  53.79 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  52.22 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  53.61 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  53.63 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  54.67 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  53.98 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  53.98 
 
 		 293 aa  288  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  56.27 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  53.63 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01426  geranyltranstransferase  57.93 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.631666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  53.95 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  51.46 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  51.9 
 
 		 296 aa  268  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  48.99 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  48.11 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  52.82 
 
 		 306 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  52.82 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  52.49 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  50.69 
 
 		 296 aa  258  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  48 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.71 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  50.33 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.71 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  50.51 
 
 		 306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  49.32 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  50 
 
 		 299 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  49.32 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  49.32 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  46.53 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  49.13 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  51.51 
 
 		 293 aa  238  9e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  45.27 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  45.27 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  49.31 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.14 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  49.01 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  45.59 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  46.23 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  48.52 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  50.74 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  49.16 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  50.37 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  47.41 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.17 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  48.15 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  43.38 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  44.85 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  47.41 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  48.48 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  46.04 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  45.39 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 295 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  49.15 
 
 		 295 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  46.9 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  47.94 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.48 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1388  polyprenyl synthetase  47.49 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.48 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  44.79 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  48.46 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  44.25 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  44.79 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  44.79 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  44.79 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  47.43 
 
 		 297 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  47.93 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  47.93 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.36 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  44.1 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  49.15 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  47.62 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  43.9 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  45.67 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  45.32 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>