121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1077 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  64.29 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  55.62 
 
 		 193 aa  200  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  51.56 
 
 		 192 aa  198  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  56.35 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  51.79 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  48.96 
 
 		 191 aa  191  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  55.31 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  48.95 
 
 		 193 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.4 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  54.21 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  46.78 
 
 		 192 aa  158  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  38.66 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  38.95 
 
 		 193 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  38.59 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  38.04 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  38.95 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  43.6 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  38.66 
 
 		 195 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  38.34 
 
 		 205 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  37.3 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  41.18 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  40.22 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  39.39 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  38.66 
 
 		 194 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  37.5 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  39.11 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  41.99 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  36.27 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  35.11 
 
 		 192 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  39.43 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  34.92 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  38.04 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  38.04 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  38.01 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  37.5 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  38.15 
 
 		 197 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  37.21 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  33.86 
 
 		 212 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  38.46 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  36.63 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  38.66 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  38.14 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  41.98 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  37.93 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  34.41 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  40.41 
 
 		 416 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  36.05 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  30.37 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  32.95 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  29.63 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  30.25 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  32.4 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  31.03 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  34.25 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  35.61 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  33.83 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  34.56 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  29.24 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  29.73 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2807  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.34 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.034805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  24.86 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  27.66 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  27.66 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  24.63 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  27.34 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  29.32 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  28.3 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1119  hypothetical protein  23.88 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000563823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  27.13 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.37 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  30.83 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  25.2 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  27.74 
 
 		 325 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  25.14 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  24.46 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  26.05 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.15 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  29.01 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  25.38 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  32 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  27.56 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  32.64 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  27.14 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0984  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.57 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  24.37 
 
 		 201 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  31.82 
 
 		 217 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.89 
 
 		 248 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1537  SNARE associated Golgi protein  30.19 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4272  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  24.37 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>