More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0091 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  100 
 
 		 516 aa  1056    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  59.14 
 
 		 524 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  56.16 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  55.34 
 
 		 667 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  55.43 
 
 		 669 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  54.44 
 
 		 673 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  54.14 
 
 		 663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  54.56 
 
 		 666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  54.46 
 
 		 663 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  51.84 
 
 		 650 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  52.35 
 
 		 542 aa  558  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  51.85 
 
 		 646 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  52.37 
 
 		 667 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  50.78 
 
 		 529 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  51.95 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  51.95 
 
 		 526 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  53.1 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  51.38 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  51.88 
 
 		 660 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  51.68 
 
 		 660 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  51.49 
 
 		 660 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  51.49 
 
 		 660 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  49.8 
 
 		 648 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  50.97 
 
 		 522 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  50.67 
 
 		 527 aa  518  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  48.42 
 
 		 521 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  45.91 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  53.72 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  45.91 
 
 		 531 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  45.91 
 
 		 531 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  45.91 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  45.72 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  45.91 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  45.91 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  45.72 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  45.72 
 
 		 531 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  45.05 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  45.05 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  45.05 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  45.05 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  45.05 
 
 		 531 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  43.52 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  43.36 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  43.58 
 
 		 553 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  42.44 
 
 		 547 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  45.77 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  41.68 
 
 		 523 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  41.6 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  45.8 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  46.02 
 
 		 513 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  46.22 
 
 		 513 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  41.23 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  46.22 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  46.22 
 
 		 513 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  46.22 
 
 		 513 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  46.02 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  41.25 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  41.91 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  40.12 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  39.92 
 
 		 530 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  40.58 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  40.81 
 
 		 533 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  40.3 
 
 		 544 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  40.81 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  38.87 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  39.73 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  40.5 
 
 		 539 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.85 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  40.61 
 
 		 523 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  38.46 
 
 		 522 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  38.83 
 
 		 526 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  40.08 
 
 		 508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 544 aa  326  5e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  37.27 
 
 		 543 aa  319  7.999999999999999e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  37.77 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  37.77 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  36.71 
 
 		 543 aa  306  7e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  30.26 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.14 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.88 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.82 
 
 		 561 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  24.9 
 
 		 505 aa  92.8  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.35 
 
 		 463 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  33.18 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.96 
 
 		 215 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  27.86 
 
 		 461 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.46 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.63 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.14 
 
 		 216 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  32.6 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.22 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  23.56 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  24.57 
 
 		 519 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.71 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.51 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.81 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.73 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.28 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>