More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00900 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00900  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 867 aa  1768    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.317293  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04006  GMC oxidoreductase (Eurofung)  33.99 
 
 		 610 aa  310  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.247886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.56 
 
 		 534 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.22 
 
 		 539 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07998  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 		 622 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.88 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.72 
 
 		 536 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09011  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 617 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.23 
 
 		 547 aa  238  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.02 
 
 		 533 aa  235  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  29.94 
 
 		 547 aa  234  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.64 
 
 		 538 aa  234  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08329  aryl-alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00610)  30.63 
 
 		 631 aa  233  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3910  Choline dehydrogenase  30.63 
 
 		 531 aa  231  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.54 
 
 		 555 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.63 
 
 		 540 aa  230  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.22 
 
 		 543 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.06 
 
 		 546 aa  225  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.25 
 
 		 544 aa  224  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.72 
 
 		 600 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0317  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 		 511 aa  222  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.02 
 
 		 551 aa  222  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.37 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01161  hypothetical alcohol dehydrogenase  29.42 
 
 		 550 aa  220  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2557  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.83 
 
 		 526 aa  220  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.62 
 
 		 569 aa  218  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.59 
 
 		 578 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.59 
 
 		 578 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.78 
 
 		 569 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.46 
 
 		 546 aa  217  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.76 
 
 		 544 aa  217  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 		 577 aa  217  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.65 
 
 		 561 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.13 
 
 		 534 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.35 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  28.9 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0670  GMC family oxidoreductase  28.57 
 
 		 534 aa  213  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.31 
 
 		 561 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.08 
 
 		 561 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6272  putative choline (or alcohol) dehydrogenase  31.24 
 
 		 544 aa  212  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  28.38 
 
 		 557 aa  212  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.97 
 
 		 534 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0443  choline dehydrogenase  29.68 
 
 		 568 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4732  choline dehydrogenase  29.68 
 
 		 568 aa  211  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.76 
 
 		 553 aa  211  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.28 
 
 		 561 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.98 
 
 		 540 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6848  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.67 
 
 		 556 aa  210  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.90225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.4 
 
 		 537 aa  209  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04212  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 		 607 aa  208  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  29.47 
 
 		 561 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  29.47 
 
 		 561 aa  209  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  29.47 
 
 		 561 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  29.47 
 
 		 561 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  29.3 
 
 		 561 aa  209  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  29.47 
 
 		 561 aa  209  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.01 
 
 		 548 aa  209  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.97 
 
 		 549 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 		 530 aa  209  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.54 
 
 		 542 aa  208  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.31 
 
 		 541 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4069  GMC family oxidoreductase  29.47 
 
 		 561 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  29.22 
 
 		 544 aa  207  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  29.98 
 
 		 541 aa  207  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3434  GMC family oxidoreductase  28.62 
 
 		 539 aa  207  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.38 
 
 		 544 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  28.43 
 
 		 534 aa  206  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.85 
 
 		 534 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  29 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.5 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1502  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.41 
 
 		 535 aa  205  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  28.34 
 
 		 551 aa  204  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 609 aa  204  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  30.35 
 
 		 550 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0845  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.73 
 
 		 536 aa  203  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189337  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09348  conserved hypothetical protein  30.44 
 
 		 672 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.130664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11305  dehydrogenase FAD flavoprotein GMC oxidoreductase  29.38 
 
 		 528 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.79 
 
 		 541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3521  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.17 
 
 		 555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.91 
 
 		 546 aa  202  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3332  oxidoreductase, GMC family protein  29.53 
 
 		 561 aa  202  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.68 
 
 		 548 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  28.67 
 
 		 571 aa  201  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  28.57 
 
 		 574 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8399  choline dehydrogenase  29.01 
 
 		 574 aa  201  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553301  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02704  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 674 aa  201  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.530018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.95 
 
 		 548 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  28.26 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.56 
 
 		 550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3050  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.03 
 
 		 564 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 		 570 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.52 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3744  choline dehydrogenase  28.95 
 
 		 554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0339169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  27.76 
 
 		 553 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1882  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 		 534 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.98 
 
 		 552 aa  199  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1514  choline dehydrogenase  28.16 
 
 		 560 aa  199  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0264792  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1279  Choline dehydrogenase  30.85 
 
 		 544 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5265  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.68 
 
 		 546 aa  197  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>