More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ03110 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  100 
 
 		 155 aa  318  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  77.78 
 
 		 155 aa  235  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  73.24 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  66.17 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  60 
 
 		 146 aa  187  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  44.53 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  38.69 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  38.89 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  37.31 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  38.3 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  39.19 
 
 		 148 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  34.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  34.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  34.07 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  37.5 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  34.07 
 
 		 149 aa  104  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  39.04 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  34.07 
 
 		 149 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  36.88 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  36.24 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  34.25 
 
 		 153 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  34.25 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  34.25 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  34.25 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  33.56 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  38.17 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  37.21 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  35.25 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  33.09 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  34.31 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  33.06 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  32.39 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  26.95 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  28.87 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  30.07 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  28.87 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  32.54 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  29.58 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  32.28 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  27.08 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  36.64 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  32.41 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  34.56 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  34.56 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  29.08 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  29.58 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  27.52 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  31.9 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  33.07 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  28.87 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  35.43 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  28.47 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  30.97 
 
 		 119 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  28.86 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  27.35 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  28.86 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  29.17 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  32.82 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  29.86 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  29.17 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  28.38 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  28.38 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  28.19 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  27.08 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  27.46 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  27.56 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  29.1 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  28.89 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  30.28 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  34.35 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>