141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01760 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND01760  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  811    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07324  N,N-dimethylglycine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_2G16610)  43.13 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0762  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 812 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3718  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 835 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 830 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 830 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.99 
 
 		 830 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 830 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.41 
 
 		 821 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3469  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 835 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3855  dimethylglycine dehydrogenase precursor  29.85 
 
 		 808 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235355  decreased coverage  0.00899155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.85 
 
 		 819 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 816 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.2 
 
 		 857 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.18 
 
 		 850 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.449188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1822  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.47 
 
 		 838 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0328882 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08654  N,N-dimethylglycine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06470)  28.08 
 
 		 948 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.12835  normal  0.470294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19690  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  27.12 
 
 		 840 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0416659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 816 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1864  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 853 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 816 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 		 815 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5914  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 853 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194637  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6885  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 853 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 853 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 815 aa  86.7  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0798  glycine cleavage system T protein  25.54 
 
 		 822 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 817 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1426  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 805 aa  73.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0785769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  24.94 
 
 		 799 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 		 823 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0486  FAD dependent oxidoreductase  23.02 
 
 		 835 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0493808  normal  0.0384194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2849  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 812 aa  70.5  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  23.26 
 
 		 837 aa  69.7  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2488  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.255163  normal  0.0203493 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 		 825 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2727  dimethylglycine dehydrogenase  23.47 
 
 		 879 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 843 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.65 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  26.73 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.05 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.19 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3533  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.972727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0284  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.19 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.73 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.19 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.19 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.73 
 
 		 369 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.73 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 830 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.32 
 
 		 983 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  27.15 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  23.99 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  24.4 
 
 		 386 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 		 831 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  22.73 
 
 		 815 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1485  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 804 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.542815  normal  0.236172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0536  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  21.19 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3155  hypothetical protein  24.88 
 
 		 831 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  22.63 
 
 		 801 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  22.99 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 827 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2198  FAD dependent oxidoreductase  22.82 
 
 		 815 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138151  normal  0.0335767 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  22.47 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 816 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  29.36 
 
 		 442 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  27.68 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  23.58 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  21.49 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2967  bifunctional enzyme involved in glycine degradation  23.06 
 
 		 831 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.782343 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4949  D-amino-acid dehydrogenase  25.68 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 984 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  25.36 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1666  dehydrogenase  23.23 
 
 		 831 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0839495 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 447 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  24.43 
 
 		 854 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4207  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.81852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 827 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.2 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.25 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  22.01 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>