179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04270 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04270  conserved hypothetical protein  100 
 
 
820 aa  1665    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.302416  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10832  RNA polymerase II Elongator subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05090)  35.86 
 
 
889 aa  419  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28574  ELongator Protein 2 90kD subunit has WD40 repeats  32.19 
 
 
812 aa  379  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.33691  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_46295  predicted protein  33.29 
 
 
670 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.723496  normal  0.226061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.23 
 
 
1236 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.51 
 
 
1557 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.2 
 
 
696 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.43 
 
 
1711 aa  80.9  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.6 
 
 
1357 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.94 
 
 
1217 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.64 
 
 
1363 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  31.03 
 
 
1163 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.18 
 
 
1364 aa  76.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.87 
 
 
1367 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.71 
 
 
1523 aa  74.7  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 
1196 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.51 
 
 
1652 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.54 
 
 
1240 aa  71.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.59 
 
 
919 aa  71.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 
947 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.93 
 
 
1193 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  33.18 
 
 
840 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.93 
 
 
1221 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  21.89 
 
 
1789 aa  68.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.3 
 
 
1443 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.65 
 
 
1661 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.94 
 
 
1686 aa  67.8  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.67 
 
 
1348 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.86 
 
 
1454 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.16 
 
 
1211 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.49 
 
 
740 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  23.75 
 
 
1344 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.76 
 
 
716 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 
1474 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 
1491 aa  65.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.99 
 
 
930 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.85 
 
 
676 aa  64.3  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.06 
 
 
924 aa  64.3  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.24 
 
 
1190 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.28 
 
 
664 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 
1177 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.1 
 
 
1760 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.77 
 
 
833 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.09 
 
 
608 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  25.93 
 
 
1100 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  31.36 
 
 
434 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.85 
 
 
596 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 
1247 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.64 
 
 
742 aa  61.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1878 aa  61.2  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  22.19 
 
 
1766 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 
728 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.87 
 
 
677 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.3 
 
 
1262 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  20.97 
 
 
1209 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  32.64 
 
 
1279 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.48 
 
 
865 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.33 
 
 
1623 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  32.64 
 
 
1279 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  27.2 
 
 
504 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.41 
 
 
1484 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.64 
 
 
1626 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.02 
 
 
682 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.8 
 
 
565 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.5 
 
 
1583 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.06 
 
 
1188 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.05 
 
 
1856 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.73 
 
 
1552 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.47 
 
 
1684 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.32 
 
 
828 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  22.2 
 
 
1373 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.37 
 
 
589 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.78 
 
 
1858 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 
578 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.18 
 
 
737 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
577 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.84 
 
 
1547 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  22.26 
 
 
316 aa  54.7  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.36 
 
 
1807 aa  54.3  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.48 
 
 
692 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.46 
 
 
630 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 
1411 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.55 
 
 
1868 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.79 
 
 
1004 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  26.82 
 
 
444 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  33.59 
 
 
1161 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  28.5 
 
 
335 aa  53.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.85 
 
 
1607 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.22 
 
 
675 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  33.59 
 
 
1161 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.32 
 
 
1214 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  24.55 
 
 
418 aa  52.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
363 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.48 
 
 
1229 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.29 
 
 
1609 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
363 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.27 
 
 
1330 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.89 
 
 
1208 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  28.8 
 
 
790 aa  52  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.47 
 
 
540 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>