232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3245 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3245  ABC transporter permease  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1447  cytochrome c assembly protein  59.35 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3840  cytochrome c assembly protein  52.84 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3221  cytochrome c assembly protein  53.49 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.119543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5083  cytochrome c assembly protein  51.35 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.402739  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1523  cytochrome c assembly protein  44.34 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2426  cytochrome c assembly protein  44.55 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1852  cytochrome c assembly protein  35.71 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2719  cytochrome c assembly protein  35.15 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0238  cytochrome c assembly protein  31.16 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3568  cytochrome c assembly protein  33.33 
 
 		 321 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0755  cytochrome c assembly protein  37.5 
 
 		 335 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.039196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4437  cytochrome c assembly protein  36.81 
 
 		 335 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0981  ABC heme exporter, inner membrane subunit C  35.25 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2580  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4369  cytochrome c assembly protein  32.64 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0837  cytochrome c assembly protein  37.74 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3129  cytochrome c assembly protein  27.98 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.291273 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1474  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  29.47 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00341992  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2365  cytochrome c assembly protein  29.19 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0985  cytochrome c assembly protein  35.56 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.012201  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1955  cytochrome c assembly protein  34.75 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.235113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2505  cytochrome c assembly protein  30.32 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1946  cytochrome c assembly protein  26.02 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446735  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03790  cytochrome c assembly protein  30.21 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2302  cytochrome c assembly protein  28.06 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267194  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07680  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  26.74 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.679091  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5876  cytochrome c assembly protein  30.36 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.30751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1245  cytochrome c assembly protein  28.46 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.695551  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4058  cytochrome c heme exporter protein  29.86 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2858  heme exporter protein CcmC  33.82 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.295334 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0334  cytochrome c assembly protein  31.34 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3988  heme exporter protein CcmC  26.27 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58743  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05020  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component  25.67 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.396568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2649  heme exporter protein CcmC  24.26 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00358111  normal  0.0120286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1685  heme exporter protein CcmC  30.28 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3361  cytochrome c assembly protein  24.86 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.249827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0936  cytochrome c assembly protein  35.23 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_002978  WD0340  heme exporter protein CcmC  33.06 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.855173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1546  heme exporter protein CcmC  31.29 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.433871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3500  heme exporter protein CcmC  31.69 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4768  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.78 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1619  heme ABC transporter membrane protein  28.75 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.192807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1562  heme exporter protein CcmC  28.75 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.41632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1212  heme exporter protein CcmC  29.08 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2849  heme exporter protein CcmC  27.78 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3741  heme exporter protein CcmC  33.9 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0321  heme exporter protein CcmC  28.37 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0889077  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0395  heme ABC transporter, permease (heme exporter protein C)  26.94 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4064  heme exporter protein CcmC  33.05 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2387  heme exporter protein CcmC  28.47 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000013635  hitchhiker  0.0000193802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1366  heme exporter protein CcmC  30.43 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0946  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.74 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1213  ABC transporter permease  29.17 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3086  heme exporter protein CcmC  31.36 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0682  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  26.95 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0372  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  24.04 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2789  heme exporter protein CcmC  25.11 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.396306  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2443  heme exporter protein CcmC  27.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4984  heme exporter protein CcmC  31.75 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2701  heme exporter protein CcmC  31.15 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.489291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0952  heme exporter protein CcmC  33.33 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.50817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5342  heme exporter protein CcmC  28.57 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3505  heme exporter protein CcmC  30.77 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0026692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1387  heme exporter protein CcmC  30.95 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0461  heme exporter protein CcmC  27.33 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.530136  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1519  heme exporter protein CcmC  26.01 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1958  heme exporter protein CcmC  30.51 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0096  heme exporter protein CcmC  29.75 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0108  heme exporter protein CcmC  31.93 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0094  heme exporter protein CcmC  29.75 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30430  cytochrome c-type biogenesis protein  30.28 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3651  heme exporter protein CcmC  23.73 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1411  heme exporter protein CcmC  27.03 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11561  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1286  heme exporter protein CcmC  27.15 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3993  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  22.46 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0320  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  27.91 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1803  ABC heme exporter, inner membrane subunit CcmC  26.09 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3660  heme exporter protein CcmC  27.35 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2279  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  25.65 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0043  heme exporter protein CcmC  27.21 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4191  ABC transporter membrane spanning protein (heme)  29.51 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0411  heme exporter protein CcmC  31.36 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0449  heme exporter protein CcmC  26.09 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0178  heme exporter protein CcmC  27.35 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3389  heme exporter protein CcmC  24.26 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1579  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  23.91 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0379  heme ABC transporter (heme exporter protein C), permease protein (cytochrome c biogenesis)  30.14 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1001  heme exporter protein CcmC  23.36 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.114267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0711  heme exporter protein CcmC  29.06 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.704774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3360  heme exporter protein CcmC  28.67 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.855911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3850  heme exporter protein CcmC  28.17 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2959  cytochrome c-type biogenesis protein CcmC  24.19 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0522  heme exporter protein CcmC  30.51 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.897478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2422  heme exporter protein CcmC  22.33 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45350  heme exporter protein CcmC  28.17 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1853  heme exporter protein C  23.86 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.024303  normal  0.648082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1389  heme exporter protein CcmC  22.61 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1381  heme exporter protein CcmC  25.83 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2166  heme exporter protein CcmC  26.57 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>