More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1292 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  95.02 
 
 		 221 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  53.88 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  52.43 
 
 		 216 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  51.94 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  54.63 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  54.63 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  52.88 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  49.51 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  55.09 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  45.89 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  45.89 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  49.51 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  46.57 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  42.58 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  46.92 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  45.89 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  43.54 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 238 aa  147  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 254 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  41.11 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  39.39 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  35.11 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 241 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  36.02 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  36.18 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  39.67 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  36.18 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>