More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0909 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  899    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 463 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  42.61 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 479 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  38.37 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 461 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  37.08 
 
 		 478 aa  305  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  37.69 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 466 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  37.98 
 
 		 468 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  37.95 
 
 		 468 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  37.89 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  37.89 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  37.89 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  37.89 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  37.89 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 447 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  34.93 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.92 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  34.72 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.55 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 474 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  32.12 
 
 		 459 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  33.11 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 451 aa  203  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.85 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  31.42 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.63 
 
 		 478 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  34.06 
 
 		 467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.41 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  32.6 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  31.42 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 460 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.4 
 
 		 450 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.2 
 
 		 474 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.56 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 398 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.33 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.57 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.79 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.96 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 473 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 399 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>