More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5071 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
485 aa  962    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  55.01 
 
 
480 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  55.2 
 
 
480 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  55.2 
 
 
480 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  53.25 
 
 
480 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  53.25 
 
 
480 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  51.19 
 
 
471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 
459 aa  346  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  40.88 
 
 
463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  38.81 
 
 
460 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  39.42 
 
 
478 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
461 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
467 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
467 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
468 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
468 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
468 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
468 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
468 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
474 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  40.53 
 
 
474 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  39.64 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  37.37 
 
 
479 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
467 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  37.16 
 
 
467 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  38.9 
 
 
466 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  39.53 
 
 
466 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  39.11 
 
 
466 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  38.9 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  39.02 
 
 
466 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  39.02 
 
 
466 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  39.02 
 
 
466 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  37.98 
 
 
434 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  37.58 
 
 
466 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.85 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.92 
 
 
455 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  31.1 
 
 
459 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31 
 
 
447 aa  190  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  31.58 
 
 
457 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  32.17 
 
 
478 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
472 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  31.96 
 
 
478 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  31.96 
 
 
478 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  31.96 
 
 
478 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  31.79 
 
 
474 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
470 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  31.96 
 
 
478 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  31.96 
 
 
478 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.32 
 
 
472 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  31.79 
 
 
474 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  31.96 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  31.79 
 
 
474 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.37 
 
 
456 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  30.77 
 
 
474 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.96 
 
 
473 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  30.09 
 
 
476 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.16 
 
 
438 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 
473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.34 
 
 
399 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  30.46 
 
 
473 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.01 
 
 
468 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  30.84 
 
 
467 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.19 
 
 
464 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29 
 
 
399 aa  157  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.22 
 
 
399 aa  156  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29 
 
 
399 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.87 
 
 
399 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  28.11 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
398 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.31 
 
 
399 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.09 
 
 
477 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 
473 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
459 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  29.1 
 
 
459 aa  147  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  27.84 
 
 
514 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.76 
 
 
399 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
435 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
398 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.91 
 
 
468 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.56 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
447 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
456 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
460 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  29.55 
 
 
398 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26.78 
 
 
438 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
445 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>