More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1640 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1640  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit  100 
 
 
245 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5007  ABC transporter related  88.93 
 
 
243 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.283517  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  81.86 
 
 
238 aa  342  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0895  ABC transporter related  68.84 
 
 
248 aa  288  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.323995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  60.38 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  60.09 
 
 
217 aa  229  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  59.15 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  60 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  60.28 
 
 
214 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 
235 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  56.28 
 
 
216 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  57.87 
 
 
231 aa  215  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  56.94 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  57.64 
 
 
225 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  52.25 
 
 
238 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1689  ABC transporter related protein  54.09 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0942959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
277 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  49.07 
 
 
235 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.18 
 
 
245 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  49.08 
 
 
255 aa  192  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.44 
 
 
264 aa  191  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  52.75 
 
 
243 aa  191  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  46.98 
 
 
233 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  46.79 
 
 
258 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  50.95 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  48.36 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  42.6 
 
 
234 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  49.26 
 
 
224 aa  188  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0805  ABC transporter related  49.26 
 
 
238 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.61 
 
 
274 aa  188  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 
228 aa  187  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.77 
 
 
280 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  47.51 
 
 
233 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.51 
 
 
233 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
233 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
233 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
233 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  38.91 
 
 
252 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  47.51 
 
 
233 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  38.91 
 
 
252 aa  187  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
233 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
233 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  47.71 
 
 
258 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.51 
 
 
233 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  46.22 
 
 
234 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.14 
 
 
238 aa  185  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  185  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.62 
 
 
263 aa  185  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 
230 aa  185  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 
253 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
234 aa  184  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  46.51 
 
 
228 aa  184  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.46 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  41.12 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  45.07 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  47 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  49.09 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  47.03 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 
230 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.25 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.29 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
266 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  44.25 
 
 
707 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
234 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
234 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.27 
 
 
230 aa  180  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
234 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  50.23 
 
 
277 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.82 
 
 
240 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  46.82 
 
 
233 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.06 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  47.44 
 
 
247 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  51.67 
 
 
249 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 
235 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
222 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  46.76 
 
 
242 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  47.91 
 
 
229 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  46.41 
 
 
269 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  44.69 
 
 
258 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
246 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
255 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  47.03 
 
 
235 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  43.98 
 
 
220 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  47.85 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  46.43 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  48.04 
 
 
236 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.5 
 
 
238 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.84 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
264 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  45.07 
 
 
237 aa  178  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.17 
 
 
236 aa  178  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>