268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3702 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3702  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.604438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  46.61 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2074  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 		 163 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4454  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2305  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 307 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2884  hypothetical protein  40.96 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.181441  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3457  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0399  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.704918  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3118  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202741  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0431  Tetratricopeptide domain protein  35.42 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.29 
 
 		 632 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.54 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 563 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.02 
 
 		 1013 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  33.68 
 
 		 648 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  37.18 
 
 		 399 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 301 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  39.71 
 
 		 222 aa  51.2  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 		 1094 aa  51.2  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2020  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 243 aa  50.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.37 
 
 		 560 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  38.96 
 
 		 875 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.46 
 
 		 561 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 405 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.5 
 
 		 561 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 4489 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  32.41 
 
 		 306 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4888  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.86 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 		 878 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 352 aa  48.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.02 
 
 		 810 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  30.59 
 
 		 561 aa  48.5  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3236  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.076369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 1737 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 3035 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  35.9 
 
 		 559 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 687 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.94 
 
 		 233 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 1276 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  32.14 
 
 		 682 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.73 
 
 		 629 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 286 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 286 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 286 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 265 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  36.62 
 
 		 582 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 265 aa  47.4  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 292 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 		 576 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 593 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 		 586 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 927 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.98 
 
 		 1764 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 722 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 486 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.17 
 
 		 820 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  37.1 
 
 		 955 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  36.62 
 
 		 706 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.73 
 
 		 462 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0909  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 		 303 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0457691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 4079 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 567 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 249 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 804 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 729 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 249 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 611 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.39 
 
 		 251 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 670 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 216 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 329 aa  45.1  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  30.53 
 
 		 578 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 747 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.67 
 
 		 581 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 3560 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.52 
 
 		 539 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 637 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 519 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 634 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 635 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 635 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 1056 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 		 626 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.5 
 
 		 397 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>