More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5693 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 224 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 214 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.56 
 
 		 220 aa  274  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 229 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.61 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.57 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  56.93 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.61 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.28 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 209 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.02 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  56.41 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.2 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  55 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  55.38 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.78 
 
 		 212 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  49.28 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  52.58 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.94 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  50.25 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.3 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  47.55 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  51.02 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.74 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.5 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.74 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  48.21 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  47 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  47 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  46.92 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 204 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.49 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  47 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1915  two component LuxR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 135 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.463472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1946  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.56 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 210 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  43.88 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5708  two component LuxR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 201 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.95 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 183 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.53 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  38.07 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.51 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>