More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4513 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  78.33 
 
 
266 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  79.47 
 
 
266 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  41.18 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  43.2 
 
 
273 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  42.26 
 
 
273 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  41.54 
 
 
281 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  42.22 
 
 
265 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  38.87 
 
 
265 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  41.39 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  42.96 
 
 
263 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  40.61 
 
 
269 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  42.64 
 
 
266 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  38.83 
 
 
273 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  40.53 
 
 
259 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  40.67 
 
 
292 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  40.53 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  39.63 
 
 
276 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  43.4 
 
 
259 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  42.64 
 
 
266 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  39.03 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.72 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  40.53 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  38.52 
 
 
272 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  37.36 
 
 
272 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  37.68 
 
 
278 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  37.69 
 
 
286 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  37.69 
 
 
296 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  38.13 
 
 
272 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  38.06 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  37.09 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  39.15 
 
 
273 aa  165  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  36.7 
 
 
270 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  38.79 
 
 
293 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  38.64 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  38.75 
 
 
268 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  38.55 
 
 
273 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  38.58 
 
 
275 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  36.19 
 
 
274 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  36.59 
 
 
274 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  36.4 
 
 
274 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  38.06 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  35.47 
 
 
265 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  35.36 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  36.43 
 
 
274 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  34.55 
 
 
272 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  34.18 
 
 
272 aa  149  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  37.31 
 
 
282 aa  148  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  37.22 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  36.82 
 
 
269 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  33.94 
 
 
272 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  32.26 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  34.64 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  35.32 
 
 
282 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  36.74 
 
 
278 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5652  hypothetical protein  34.71 
 
 
311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  33.46 
 
 
273 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  34.23 
 
 
316 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  36.68 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  36.82 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  33.22 
 
 
297 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  33.9 
 
 
311 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  31.91 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  30.38 
 
 
295 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.75 
 
 
326 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  32.87 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 
352 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 
361 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  32.05 
 
 
344 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  31.49 
 
 
366 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 
367 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1917  transglutaminase domain-containing protein  31.17 
 
 
345 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  32.53 
 
 
297 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  32.67 
 
 
326 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04340  Transglutaminase-like protein  33.22 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.920797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.82 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  34.29 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.24 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0543  transglutaminase-like  31.47 
 
 
296 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  30.29 
 
 
307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0681  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
350 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2057  transglutaminase domain-containing protein  31.7 
 
 
340 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  31.62 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  31.56 
 
 
292 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  34.06 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3507  transglutaminase-like protein  34.06 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3579  transglutaminase domain-containing protein  34.06 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0283063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1776  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0772  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.11713  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2035  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0841583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3877  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1060  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0767  transglutaminase domain-containing protein  31.37 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.321823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  31.18 
 
 
316 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 
308 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  29.67 
 
 
304 aa  115  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4112  transglutaminase domain-containing protein  31.39 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.822684  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  31.39 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  31.54 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>