More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0940 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0940  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 355 aa  709    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  33.52 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  33.52 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  30.29 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.57 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.12 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  31.77 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  32.19 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  31.04 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  32.96 
 
 		 358 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.11 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  28.85 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  30.11 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  29.82 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.9 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  29.94 
 
 		 375 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  29.6 
 
 		 365 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  30.61 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  29.38 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  28.7 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  29.3 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  28.61 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  31.25 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  29.35 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  28.65 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  27.07 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  29.8 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.4 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.64 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  31.32 
 
 		 365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  28.21 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  29.17 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  26.5 
 
 		 377 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  28.69 
 
 		 365 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  27.99 
 
 		 370 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  27.99 
 
 		 370 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  27.54 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  27.37 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  31.23 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  28.02 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  27.3 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  28.07 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  28.65 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.91 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  29.21 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  27.1 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1549  DNA replication and repair protein RecF  31.09 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.638976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.3 
 
 		 373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0230  DNA replication and repair protein RecF  29.45 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000612971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  27.92 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  29.07 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  28.53 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  24.93 
 
 		 390 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  27.59 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  25.81 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.95 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.36 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.65 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.4 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.55 
 
 		 353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  28 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  25.36 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  26.25 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.61 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  27.49 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  25.89 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0043  DNA replication and repair protein RecF  25.77 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.4 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  23.18 
 
 		 377 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  22.7 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  23.77 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  26.16 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  23.46 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  26.67 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  25.89 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  26.09 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  29.43 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  30.18 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  30.09 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  23.63 
 
 		 414 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  22.69 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0053  DNA replication and repair protein RecF  24.64 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.03 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  24.79 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  23.24 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  22.69 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  22.69 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  22.29 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  25.79 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  24.8 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  24.14 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  26.27 
 
 		 394 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2998  DNA replication and repair protein RecF  25.71 
 
 		 357 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0957887  normal  0.356139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>