More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6171 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  96.54 
 
 
489 aa  914    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  96.13 
 
 
489 aa  910    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  77.68 
 
 
489 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  96.13 
 
 
489 aa  910    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  77.9 
 
 
516 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  77.68 
 
 
489 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
491 aa  973    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  91.89 
 
 
488 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  77.68 
 
 
489 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  77.45 
 
 
489 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  73.25 
 
 
484 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0706  heavy metal efflux system membrane fusion protein  71.08 
 
 
491 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0868485  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  77.68 
 
 
489 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  76.87 
 
 
489 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5981  cation proton antiporter efflux protein CzcB  50.9 
 
 
520 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000176523  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1763  Membrane Fusion Protein cluster 2 protein  50.9 
 
 
520 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.305253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  50.45 
 
 
538 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  44.89 
 
 
503 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  48.57 
 
 
484 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  60.23 
 
 
459 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  57.48 
 
 
401 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.46 
 
 
433 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  47.73 
 
 
484 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  52.97 
 
 
456 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3969  secretion protein HlyD  53.39 
 
 
407 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  54.12 
 
 
416 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0492  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  56.38 
 
 
404 aa  348  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  54.41 
 
 
404 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  53.1 
 
 
422 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  50.87 
 
 
410 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  54.41 
 
 
404 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.67 
 
 
531 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  54.01 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  54.71 
 
 
397 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  51.62 
 
 
424 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  50.74 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  50.74 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  50.74 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  50.74 
 
 
416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  40.98 
 
 
509 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  47.35 
 
 
421 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1339  secretion protein HlyD  42.39 
 
 
502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  44.48 
 
 
400 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 
457 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1071  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4123  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.82 
 
 
454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.860452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2139  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 
457 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 
459 aa  210  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1403  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 
459 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  32.66 
 
 
424 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 
423 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.52 
 
 
400 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 
410 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  32.24 
 
 
399 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.63 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.67 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1888  secretion protein HlyD  34.76 
 
 
399 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  32.63 
 
 
418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  30.86 
 
 
398 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.12 
 
 
587 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2608  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 
387 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0604654  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2320  RND family efflux transporter MFP subunit  34.58 
 
 
399 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0616  RND family efflux transporter MFP subunit  43.52 
 
 
329 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2448  secretion protein HlyD  34.69 
 
 
382 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1045  HelB protein  37.82 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1019  secretion protein HlyD  34.42 
 
 
456 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.194662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 
424 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2568  secretion protein HlyD  35.58 
 
 
389 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2372  HelB protein  37.82 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  33.85 
 
 
308 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1456  secretion protein HlyD  37.11 
 
 
330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.134538  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1849  secretion protein HlyD  38.14 
 
 
327 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2345  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.34 
 
 
331 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  39.9 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  0.355177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.27 
 
 
330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7182  putative cation efflux system protein czcB  36.6 
 
 
330 aa  131  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2143  secretion protein HlyD  37.31 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  29.81 
 
 
384 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7265  putative cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcB (cation efflux system protein czcB)  36.6 
 
 
315 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0692053  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4155  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.259995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3647  secretion protein HlyD  36.79 
 
 
318 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 
359 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1342  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.92 
 
 
365 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754197  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3342  secretion protein HlyD  34.72 
 
 
331 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4531  secretion protein HlyD  35.62 
 
 
316 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  32.2 
 
 
371 aa  124  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  34.82 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0747  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.7 
 
 
405 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 
530 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  28 
 
 
388 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4294  RND family efflux transporter MFP subunit  27.82 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
402 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  26.35 
 
 
368 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  28.06 
 
 
467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.45 
 
 
472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  25.97 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  25.65 
 
 
361 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  29.57 
 
 
413 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>