More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26790 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  100 
 
 		 337 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  54.93 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  57.84 
 
 		 305 aa  282  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3252  porphobilinogen deaminase  55.49 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0180697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  50.75 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  56.27 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  54.98 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2732  porphobilinogen deaminase  50.75 
 
 		 320 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  52.6 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  48.63 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  50.9 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  58.5 
 
 		 358 aa  245  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0262  porphobilinogen deaminase  47.43 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.207863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  50.76 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  55.94 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  49.86 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  48.65 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  55.38 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4012  porphobilinogen deaminase  59.85 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  normal  0.94998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0668  porphobilinogen deaminase  48.64 
 
 		 318 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  56.13 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  52.12 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  48.8 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0670  porphobilinogen deaminase  48.35 
 
 		 314 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  47.45 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  43.03 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0677  porphobilinogen deaminase  48.05 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0690  porphobilinogen deaminase  48.05 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.118278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  53.36 
 
 		 316 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  44.11 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 314 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  41.79 
 
 		 318 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10521  porphobilinogen deaminase  55.16 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  45.72 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  45.15 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  41.62 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  43.94 
 
 		 313 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  46.65 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 318 aa  212  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6130  porphobilinogen deaminase  44.09 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  38.62 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0618  porphobilinogen deaminase  59.6 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0490105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  42.9 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0486  porphobilinogen deaminase  44.97 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.471298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  39.36 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  42.73 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  43.94 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.35 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  40.54 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  37.39 
 
 		 313 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  36.12 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  42.69 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  41.19 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  34.73 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  41.87 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  36.13 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  38.51 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  40.42 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  40.36 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  40.42 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  35.03 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 305 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  39.57 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.7 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  37.39 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  40.12 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  39.94 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  36.56 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  41.37 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  40.54 
 
 		 308 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  36.8 
 
 		 313 aa  189  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 300 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  41.62 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  40.9 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  39.04 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  40.24 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  39.23 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  39.16 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  33.63 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  39.52 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  41.26 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>