More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5368 on replicon NC_010181
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010181  BcerKBAB4_5368  integrase family protein  100 
 
 		 386 aa  786    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196734  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0056  integrase-recombinase  31.55 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0611528  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5606  integrase family protein  31.03 
 
 		 390 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0057  integrase-recombinase  28.21 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0945594  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0232  integrase/recombinase, putative  28.37 
 
 		 347 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000342454  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0189  integrase/recombinase, putative  28.37 
 
 		 347 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122412  hitchhiker  3.7857800000000004e-44 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0182  integrase/recombinase  29.46 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.44216  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0234  phage integrase family protein  27.81 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92147e-39 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.89 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.25 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  23.59 
 
 		 294 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.89 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.52 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  23.91 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  24.73 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  25.31 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  24.2 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  25.38 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  22.18 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.76 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.16 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  22.9 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.77 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  24.12 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  24.44 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  27.37 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  23.38 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  24.2 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  25.64 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  24.77 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  23.74 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.56 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  23.33 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.2 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  25.11 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  23.48 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  29.18 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.88 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  22.03 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  23.59 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  24.79 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.46 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  23.59 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  22.03 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  23.53 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2178  phage integrase family protein  23.68 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  23.24 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  23.28 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.81 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  25.48 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  24.31 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  25.11 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  23.87 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.9 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  22.95 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  24.89 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  24.18 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.05 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  24.24 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.3 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3617  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  25.49 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.5 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.75 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  22.89 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  23.11 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  24.15 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.97 
 
 		 301 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  24.75 
 
 		 313 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  22.59 
 
 		 328 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.38 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  22.71 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 317 aa  53.5  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.74 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.53 
 
 		 450 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  22.82 
 
 		 324 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>