More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2486 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 291 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  70.24 
 
 		 289 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  68.51 
 
 		 289 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  68.17 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  68.51 
 
 		 289 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  68.51 
 
 		 289 aa  427  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  68.17 
 
 		 289 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  68.51 
 
 		 289 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  68.17 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3685  nucleotide-binding SMF protein  62.62 
 
 		 221 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.455152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  46.53 
 
 		 294 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  44.26 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  44.31 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  48.89 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.49 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.08 
 
 		 356 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.76 
 
 		 358 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  48.36 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42 
 
 		 362 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 360 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  44.14 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  45.87 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  44.12 
 
 		 361 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 389 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  45.18 
 
 		 362 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  48.62 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.07 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  46.61 
 
 		 364 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  46.76 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  49.5 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  47 
 
 		 372 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.47 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  46.67 
 
 		 364 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  42.64 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  46.89 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  47.62 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  47.55 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  42.26 
 
 		 361 aa  185  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  42.34 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.4 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.59 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  45.33 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.89 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.24 
 
 		 359 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  46.41 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  46.67 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  38.08 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  46.41 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  47.37 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  42.91 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  47.03 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  43.64 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  47.66 
 
 		 425 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  43.12 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 442 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  39.2 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.82 
 
 		 385 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  46.41 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  37.15 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  46.45 
 
 		 553 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  45.16 
 
 		 264 aa  179  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  41.73 
 
 		 377 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  44.17 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  43.18 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  43.36 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.51 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  39.05 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.42 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  41.63 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  46.15 
 
 		 401 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 383 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  41.56 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.02 
 
 		 382 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  43.44 
 
 		 399 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  40.14 
 
 		 373 aa  175  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 		 364 aa  175  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  46.89 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 337 aa  175  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  45.62 
 
 		 377 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  39.1 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  45.02 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  36.69 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  41.4 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  45 
 
 		 368 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.85 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 402 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  45.89 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 401 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>