More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4318 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  98.69 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  98.69 
 
 
305 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  95.08 
 
 
305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  93.67 
 
 
301 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  93.67 
 
 
301 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  83.28 
 
 
312 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  64.93 
 
 
318 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  61.11 
 
 
314 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  64.6 
 
 
285 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  64 
 
 
299 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  64 
 
 
299 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 
298 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  47.86 
 
 
285 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 
304 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 
291 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
291 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.85 
 
 
291 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 
304 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  33.05 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 
291 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 
353 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 
289 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
312 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 
308 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.5 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 
293 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 
251 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.95 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 
293 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
291 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.21 
 
 
303 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
315 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
315 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 
315 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  27.89 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
678 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  26.59 
 
 
293 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
287 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  29.41 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  28.5 
 
 
296 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 
299 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
249 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
361 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  24.76 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  31.8 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  28.17 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  33.12 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.45 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>