More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3467 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4899  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.988384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3467  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5387  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444509 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0810  LysR family transcriptional regulator  89.54 
 
 		 306 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.735015  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4377  LysR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394868 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06019  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001369  putative transcriptional regulator LysR family protein  35.35 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.388836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0337  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3744  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4821  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3348  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05463  transcription regulator protein  33 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.163697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  36.3 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5571  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5199  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.2 
 
 		 312 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.505571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5239  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0547  transcriptional regulator, LysR family protein  29.57 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444887  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 294 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2963  LysR, substrate-binding  29.57 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0556  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2820  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5571  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.56 
 
 		 326 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0922437  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 351 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  33.58 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  32.66 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1337  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1421  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112805  normal  0.410209 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  30.51 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.07 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0824  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1357  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  31.53 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3439  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0327434  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  31.19 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0938  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0695  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000273507  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3327  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.114009  normal  0.9019 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3048  helix-turn-helix, Fis-type  31.35 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4124  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.774115  decreased coverage  0.0000191033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3182  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3156  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000483738  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.65 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3219  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00312841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  31.08 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>