More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4685 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  607  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  81.4 
 
 		 303 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  71.1 
 
 		 301 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  65.67 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  65.67 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  70.1 
 
 		 300 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  66 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  66 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 305 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  56.48 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  62 
 
 		 307 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2763  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0559  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2878  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2451  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2822  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2830  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0509138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1151  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1774  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.793189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0672  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1746  LysR family transcriptional regulator  65.68 
 
 		 303 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1033  LysR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  61.87 
 
 		 314 aa  361  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  61.07 
 
 		 308 aa  352  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  59.2 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  59.2 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  59.2 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  55.48 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 322 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 302 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 302 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 297 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0756  LysR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 305 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 307 aa  321  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 302 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  54.45 
 
 		 305 aa  311  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3137  transcriptional regulator, LysR family  48.84 
 
 		 319 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00811136  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  48.15 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33440  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 312 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0395632  normal  0.113428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3004  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.67 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 336 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.78 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 321 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 323 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 325 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5119  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  43.69 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 300 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  43.58 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2006  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>